ＳＬＥ，虽然可以侵害身体各器官，但最少见的还是侵害肾脏。多达，大约７５％的病人有蛋白尿，即已再次发生狼疮肾炎。
肾前列腺对本病的临床、化疗和肾功能的估算都很有价值。ＳＬＥ的主要丧生原因，是狼疮肾炎引发的尿毒症。狼疮肾炎引发血肌酐增高和（或）高血压，是ＳＬＥ肾功能不佳的主要指标之一。
狼疮肾炎的化疗，与ＳＬＥ亦有些有所不同。例如，在用于环磷酰胺冲击疗法时，前者的用量不应较后者大。
美国国立公共卫生研究院肾脏病研究所建议狼疮肾炎的用量为１克／平方米（体表面积）。国内多个研究中心报告，在规范化疗的基础上，加用中药做到辅助化疗，疗效不会更佳些。 得了狼疮肾炎不要害怕，随着早期临床的手段激增和化疗水平的提升，在有经验的肾科专家化疗下，狼疮肾炎的肾功能明显改善。
目前５年存活率大约为８５％，１０年存活率大约为７５％，２０年存活率大约为６８％。辨别狼疮否活动和活动程度，是给与恰如其分的化疗的关键。 患者自己宜留意，特例症状回应狼疮正处于活动期：①蛋白尿、血尿、血肌酐增高；②多关节发炎、关节痛；③癫痫发作、精神异常；④皮疹、皮肤血管炎、口腔黏膜溃疡；⑤胸膜炎、心包炎；⑥溶血性贫血、血小板增加、淋巴球绝对值增大；⑦痉挛、力弱、疲惫；⑧血清Ｃ３、Ｃ４水平上升；⑨外用ｄｓＤＮＡ抗体增高；⑩血沉减缓。
肾病是导致狼疮患者丧生的主要原因。因此如何维护自己的肾，避免肾病的再次发生，以及若有数肾病，不应如何避免肾功能中风好转，这些都变得极为重要。 首先，不应在医生指导下，如期按量服用激素及免疫系统抑制剂。有些患者惧怕衣激素后体重增加，影响美观，尤其是年长女孩子，经常自行将激素保护环境或戒断，导致狼疮的发作或减轻，引发肾损害或减轻肾功能伤害。
其二，不应定期检查尿常规及肾功能，及时理解肾脏情况。其三，不应常常测血压、坎肝功能和电解质等。此外，大力因应医生尽早行肾前列腺，不利于医生辨别疾病的肾功能，制定出更合理的化疗方案。有的患者担忧肾穿刺危险性而拒绝接受检查，只不过只要患者很好因应，在放血前作好充分准备，一般会发生意外，也会留给后遗症。
只有早期的合理化疗，才能避免肾功能中风，缩短狼疮肾炎患者的生存期。 在此要警告患者留意，在激素化疗期间不应森严留意若无拆分病毒感染，若无所致高血压、消化道溃疡等不良反应。
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